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Swift 建库服务

一、服务内容


我公司提供的Swift建库服务是基于Swift公司提供的不同文库构建试剂盒,对DNA样本进行文库构建,建成适用于illumina测序平台的DNA测序文库。

 

二、建库分类及特点


1、Accel-NGS 1S DNA 建库

利用Swift创新技术设计的适用于Illumina® 平台的单链 DNA文库构建试剂盒,也适用于双链DNA和质量较差的DNA样品(缺刻﹑损伤或含有小片段)。接头连接效率高、较低的样品输入量,起始量低至10pg,生成的文库序列质量高﹑覆盖度均匀。可用于宏基因组学研究、病毒基因组学研究、较难提取的微生物研究和热变性致病菌研究。

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2、Accel-NGS 2S DNA 建库

Accel-NGS 2S DNA文库试剂盒操作简便,包含了建库必需的全部试剂,可兼容包括微生物、FFPE以及cfDNA样品等多种样品类型。应用范围广,既适用于PCR-free全基因组测序及ChlP-Seq,也可结合杂交捕获用于靶向重测序。Accel-NGS 2S试剂盒提供优化的标签序列,既有样品标签(sample indices)用于多样品文库混合测序,还有分子标签(molecular identifiers, MIDs)用于数据分析时过滤重复序列。


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3、Swift Amplicon 16S+ITS 建库

—种基于单管反应微生物高通量综合分析方法。解析复杂的宏基因组样品可以覆盖16S rRNA的所有可变区和真菌的ITS1、ITS2基因区域。解决了测序复杂度问题独特的扩增子化学试剂产出多样性的簇,不需要PhiX或者定相引物,有效reads数量至少增加了 20%。节约成本适应多种Illumina园测序机型和测序读长,增大了选择的灵活性,可订购384种index试剂盒pooling更多样品。Swift Amplicon 16S + ITS PanelB基于16S rRNA可变区(V1-V9)和ITS基因设计的单管多重引物体系,有利于对复杂的微生物群落(例如细菌,古菌,真菌)的NGS分析。


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4、Accel-NGS 甲基化DNA建库

Accel-NGS-Methyl-Seq DNA文库试剂盒最大限度地提高了亚硫酸氢钠转化样品的DNA回收率,并构建了准确表示样品组成的文库。 Accel-NGS-Methyl-Seq工作流程通过利用与单链亚硫酸氢钠转化DNA兼容的高效 adapter连接,制备亚硫酸氢钠处理后的文库,最大限度地恢复DNA。这个方法的文库产量比库构建后再亚硫酸氢钠转化的方法高出100倍。此外,Accel-NGS-Methyl-Seq试剂盒的 adapter连接与模板无关,提供了一个更完整、更底偏好的文库,这是从全基因组甲基化测序(WGBS)对甲基组的全面覆盖中观察到的。 已在gDNA、cfDNA、FFPE和古DNA样本中得到过验证,使用同样的样品起始量,需要扩增循环数更低 。建库起始量的要求低至100pg,Swift先对DNA进行重亚硫酸盐处理再建库,对比其它先建库再重亚硫酸盐处理的方法,可保持原始DNA分子的多样性和降低DNA的投入量。可广泛应用于 全基因组甲基化测序(WGBS)、简化甲基化测序(RRBS)、杂交捕获的靶向测序、通过ChIP或其它方法富集得到的重亚硫酸盐转化的DNA。

卓越的文库复杂度和覆盖度:为了证明Accel-NGS-Methyl-Seq试剂盒的有效性和无偏性,我们使用100ng、10ng或1ng拟南芥基因组DNA进行了滴定实验,并与使用相同样本量的两种替代方法(随机引物和传统方法)进行了比较。


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三、样品要求


1、Accel-NGS 1S DNA 建库

DNA 浓度大于0.5ng/ul。

DNA 样品体积大于10ul。

DNA 总量大于10ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之间。


2、Accel-NGS 2S DNA 建库

DNA 浓度大于5ng/ul。

DNA 样品体积大于10ul。

DNA 总量大于50ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之间。


3、Swift Amplicon 16S+ITS 建库

DNA 浓度大于1ng/ul。

DNA 样品体积大于10ul。

DNA 总量大于20ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之间。


4、Accel-NGS 甲基化DNA建库

DNA 浓度大于5ng/ul。

DNA 样品体积大于10ul。

DNA 总量大于50ng。

DNA 的吸光度260/280比值在1.7-2.1之间。


注意:请附送一管DNA样品的溶解介质。

请务必保证样品运送过程中温度保持在4度以下,夏季以干冰运送为好。