Chromium单细胞基因表达解决方案能够提供单细胞转录组3'基因表达和多组学功能,可同时对成千上万个细胞进行分析。通过结合单细胞水平的基因表达、细胞表面蛋白表达或CRISPR编辑,可以探索细胞异质性,鉴定新的靶点及生物标志物。
高通量单细胞分析 | 多组学细胞读数 | 可扩展的功能基因组学 | |||
捕获样本中成千上万个细胞的完整异质性。 | 可检测3’ mRNA、细胞表面蛋白、CRISPR扰动及其他。 | 通过配对的CRISPR敲除和全转录组读数来探索基因网络。 | |||
简化的数据分析 | 为期一天的实验室流程 | 兼容不同的样本 | |||
使用易用的软件来探索和解释单细胞基因表达谱。 | 在一天之内完成从样本到可测序文库的过程。 | 经验证适用于固定、新鲜和冷冻的样本,以及完整的细胞和细胞核。 |
通过单细胞多组学探索您的应用
灵活的解决方案 满足您各种需求
单细胞基因表达的标准 | ||
开启您的单细胞基因表达实验--使用可以负担的适用于小型项目的解决方案进行试点研究或优化实验条件。
单细胞基因表达低通量解决方案 | ||
开启您的单细胞发现之旅。仅需100-1,000个细胞即可进行试点研究,启动初步研究或进行样本制备优化。 | ||
观看产品网络研讨会 > | ||
获得初步见解 | 优化样本制备 | 从样本制备到数据分析的全面支持 |
通过小规模研究,从100-1,000个细胞中找到可揭示的内容。 | 优化实验条件,提高您的研究成功率。 | 从技术资源到用户友好的基于云的数据分析都将为您提供端到端的支持。 |
同时测量细胞表面蛋白表达或CRISPR扰动与基因表达。
CRISPR筛选 | |
通过对细胞内sgRNA的直接捕获和基因表达的变化,以单细胞分辨率评估CRISPR扰动带来的影响。 | |
查看信息图 > | |
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细胞表面蛋白 | |
综合分析单细胞的基因和蛋白表达,以便发现新的细胞亚群和罕见的细胞群体。 | |
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单细胞基因表达Flex
Chromium单细胞基因表达Flex能够提供单细胞基因表达和混样功能,以分析数百到一百万个细胞。在样本采集点进行固定可保留脆弱样本的生物学特征,并大大简化工作流程,带来更多样本的生物学见解。
通过Chromium Connect 单细胞基因表达解决方案获得一致性高、重复性好的结果,大大提高实验室生产力。
完整的解决方案
基于Next GEM技术的Chromium仪器 Chromium X Series 通量灵活、可拓展 Chromium Controller 小巧灵活 Chromium Connect 自动化 |
Chromium单细胞基因表达试剂 利用我们的试剂盒,您可以捕获和扩增3’ mRNA,鉴定CRISPR扰动或开展其他应用。 | 分析和可视化软件
Cell Ranger 数据分析流程 Loupe Browser 数据可视化软件 | 世界级的技术支持和客户支持 您可以通过电话或电子邮件联系我们的 专家支持团队。 |
工作流程
单细胞基因表达的基本工作流程如下所示。若您使用我们的Feature Barcode试剂盒来分析CRISPR或细胞表面蛋白,我们将会提供其他方案用于修饰您感兴趣的蛋白。
样本制备 从成百上千个细胞开始。按照洗涤、计数和浓缩细胞的高效做法,尽量减少细胞团块的存在,回收高质量的单细胞悬液。 | 文库构建 利用我们的试剂盒和Chromium Controller构建带有10x条形码的文库。 Chromium Controller将每个带有10x条形码的凝胶珠的细胞封装在单个液滴中。在每个纳升级的液滴中,细胞经过逆转录生成cDNA,其中单个细胞的所有cDNA都带有共同的10x条形码。 | 测序 第2步所生成的10x条形码文库与Illumina测序仪上的标准短读长NGS测序兼容,能够实现数千个单细胞的大规模转录分析。 |
数据分析 我们的Cell Ranger分析软件可生成每个细胞的表达谱,鉴定表达谱相似的细胞簇,还能够对多个样本的数据进行合并分析。 分析流程输出 输出结果包括质控信息和文件,这些文件可轻松用于Loupe可视化软件或第三方R工具及Python工具的进一步分析。 | 数据可视化 利用我们的Loupe Browser可视化软件,您可以交互式地探索实验结果,研究目的基因的表达模式,确定细胞类型,并开展细胞簇和样本之间的比较分析。 只有生物信息专家才能使用吗? Loupe是点选式软件,任何人都可以轻松下载和使用。 |
常 见 问 题
Chromium单细胞基因表达能够实现哪种分析?
它提供了一种全面的方法,来分析基因表达(全转录组或靶向),以及细胞表面蛋白或CRISPR编辑对复杂生物学的多维见解。
能够分析哪些类型的RNA?
只要是表达聚腺苷酸化mRNA分子的细胞类型,都与该单细胞RNA-seq流程兼容。
与哪些类型的样本兼容?
Chromium单细胞基因表达与新鲜、固定(甲醇)和冷冻的单细胞或单细胞核悬液兼容。兼容的物种包括人、小鼠、大鼠、模式生物以及植物。
如何分析我的单细胞数据?
10x Genomics提供了两种类型的软件,可帮助您分析数据:Cell Ranger和Loupe Browser。Cell Ranger这款分析软件能够自动生成每个细胞的表达谱,并鉴定表达谱相似的细胞簇。随后,您可以利用Loupe Browser可视化软件来交互式地探索实验结果。您可以从10x支持网站上免费下载Cell Ranger和Loupe Browser。
细胞大小是否存在限制?
我们在内部测试了直径达到30微米的细胞。此外,许多客户文献也成功证明了对各类细胞的兼容性,如肝细胞、成纤维细胞和心肌细胞,它们的大小往往超过30微米。
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